Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trem3Q9JKE1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms