Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pard6bQ9JK83 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms