Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfra4Q9JJT2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra4Q9JJT2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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