Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrip3Q9JJR9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrip3Q9JJR9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms