Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR5

Akip1, A-kinase-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akip1Q9JJR5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Akip1Q9JJR5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Akip1Q9JJR5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Akip1Q9JJR5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Akip1Q9JJR5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Akip1Q9JJR5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms