Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN4

Oxct2a, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2aQ9JJN4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Oxct2aQ9JJN4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Oxct2aQ9JJN4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Oxct2aQ9JJN4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Oxct2aQ9JJN4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Oxct2aQ9JJN4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Oxct2aQ9JJN4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Oxct2aQ9JJN4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Oxct2aQ9JJN4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Oxct2aQ9JJN4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Oxct2aQ9JJN4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Oxct2aQ9JJN4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Oxct2aQ9JJN4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Oxct2aQ9JJN4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Oxct2aQ9JJN4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Oxct2aQ9JJN4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Oxct2aQ9JJN4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Oxct2aQ9JJN4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Oxct2aQ9JJN4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms