Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms