Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms