Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Brd4Q9ESU6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Brd4Q9ESU6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms