Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hapln2Q9ESM3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hapln2Q9ESM3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms