Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ush1cQ9ES64 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ush1cQ9ES64 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ush1cQ9ES64 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ush1cQ9ES64 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ush1cQ9ES64 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ush1cQ9ES64 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ush1cQ9ES64 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ush1cQ9ES64 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ush1cQ9ES64 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ush1cQ9ES64 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ush1cQ9ES64 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ush1cQ9ES64 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ush1cQ9ES64 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ush1cQ9ES64 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ush1cQ9ES64 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ush1cQ9ES64 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms