Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ParvbQ9ES46 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParvbQ9ES46 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms