Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3bQ9ES34 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.29■■□□□ 1
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