Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms