Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Wdr61Q9ERF3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms