Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr6Q9EQ16 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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