Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS6

Vmn1r171, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r171Q9EPS6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r171Q9EPS6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r171Q9EPS6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms