Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s1Q9DCR2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms