Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCQ7

Serpina1f, Alpha-1-antitrypsin 1-6, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1fQ9DCQ7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Serpina1fQ9DCQ7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Serpina1fQ9DCQ7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Serpina1fQ9DCQ7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Serpina1fQ9DCQ7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1fQ9DCQ7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1fQ9DCQ7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1fQ9DCQ7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1fQ9DCQ7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1fQ9DCQ7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1fQ9DCQ7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1fQ9DCQ7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1fQ9DCQ7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1fQ9DCQ7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1fQ9DCQ7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1fQ9DCQ7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1fQ9DCQ7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1fQ9DCQ7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1fQ9DCQ7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms