Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hmgn3Q9DCB1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgn3Q9DCB1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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