Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk1dQ9DC28 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1dQ9DC28 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms