Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxp4Q9DBY0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxp4Q9DBY0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms