Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms