Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ftsj3Q9DBE9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms