Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms