Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Znf580Q9DB38 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf580Q9DB38 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf580Q9DB38 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf580Q9DB38 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf580Q9DB38 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Znf580Q9DB38 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf580Q9DB38 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf580Q9DB38 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf580Q9DB38 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf580Q9DB38 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf580Q9DB38 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Znf580Q9DB38 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Znf580Q9DB38 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf580Q9DB38 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf580Q9DB38 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf580Q9DB38 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Znf580Q9DB38 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf580Q9DB38 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf580Q9DB38 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf580Q9DB38 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Znf580Q9DB38 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Znf580Q9DB38 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Znf580Q9DB38 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf580Q9DB38 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Znf580Q9DB38 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf580Q9DB38 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf580Q9DB38 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf580Q9DB38 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Znf580Q9DB38 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Znf580Q9DB38 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Znf580Q9DB38 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Znf580Q9DB38 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Znf580Q9DB38 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf580Q9DB38 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf580Q9DB38 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf580Q9DB38 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf580Q9DB38 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf580Q9DB38 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf580Q9DB38 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf580Q9DB38 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf580Q9DB38 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf580Q9DB38 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf580Q9DB38 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf580Q9DB38 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf580Q9DB38 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf580Q9DB38 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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