Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc89Q9DA73 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc89Q9DA73 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc89Q9DA73 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc89Q9DA73 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc89Q9DA73 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc89Q9DA73 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc89Q9DA73 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc89Q9DA73 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc89Q9DA73 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc89Q9DA73 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc89Q9DA73 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc89Q9DA73 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc89Q9DA73 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc89Q9DA73 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc89Q9DA73 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc89Q9DA73 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc89Q9DA73 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc89Q9DA73 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms