Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms