Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9D9H8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D9H8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D9H8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9D9H8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9D9H8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D9H8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9D9H8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q9D9H8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms