Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot8Q9D8X5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms