Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9D8Q6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9D8Q6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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