Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8M3

Slc48a1, Heme transporter HRG1, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc48a1Q9D8M3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc48a1Q9D8M3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc48a1Q9D8M3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc48a1Q9D8M3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc48a1Q9D8M3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc48a1Q9D8M3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc48a1Q9D8M3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc48a1Q9D8M3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc48a1Q9D8M3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc48a1Q9D8M3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc48a1Q9D8M3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc48a1Q9D8M3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc48a1Q9D8M3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc48a1Q9D8M3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc48a1Q9D8M3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc48a1Q9D8M3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc48a1Q9D8M3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms