Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl4Q9D8E6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 318.4 ms