Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med11Q9D8C6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med11Q9D8C6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms