Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fip1l1Q9D824 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms