Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slx4ipQ9D7Y9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms