Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms