Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms