Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf13Q9D777 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.3 ms