Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
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Borcs6Q9D6W8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Borcs6Q9D6W8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Borcs6Q9D6W8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Borcs6Q9D6W8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Borcs6Q9D6W8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Borcs6Q9D6W8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Borcs6Q9D6W8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Borcs6Q9D6W8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Borcs6Q9D6W8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Borcs6Q9D6W8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Borcs6Q9D6W8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Borcs6Q9D6W8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Borcs6Q9D6W8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Borcs6Q9D6W8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Borcs6Q9D6W8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Borcs6Q9D6W8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Borcs6Q9D6W8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Borcs6Q9D6W8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Borcs6Q9D6W8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Borcs6Q9D6W8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Borcs6Q9D6W8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
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Borcs6Q9D6W8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Borcs6Q9D6W8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Borcs6Q9D6W8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Borcs6Q9D6W8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Borcs6Q9D6W8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
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Borcs6Q9D6W8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms