Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb8Q9D6J5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms