Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms