Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D4W2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D4W2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D4W2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D4W2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D4W2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D4W2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D4W2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms