Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcc1Q9D4H2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms