Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D454 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D454 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D454 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D454 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D454 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D454 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D454 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D454 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D454 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D454 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D454 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D454 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D454 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D454 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D454 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D454 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D454 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D454 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D454 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D454 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D454 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D454 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D454 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D454 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D454 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D454 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D454 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D454 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D454 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D454 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D454 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D454 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D454 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D454 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D454 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D454 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D454 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D454 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D454 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D454 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D454 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D454 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D454 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D454 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D454 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D454 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D454 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D454 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D454 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D454 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D454 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D454 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D454 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D454 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D454 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D454 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D454 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D454 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D454 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D454 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D454 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D454 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D454 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D454 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D454 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D454 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D454 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D454 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D454 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D454 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D454 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D454 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D454 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D454 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D454 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D454 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D454 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D454 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D454 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D454 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D454 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D454 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D454 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D454 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D454 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D454 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D454 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D454 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D454 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D454 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D454 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D454 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D454 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D454 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D454 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D454 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms