Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D3J9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D3J9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D3J9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D3J9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D3J9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D3J9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D3J9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms