Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700034E13RikQ9D2T6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
1700034E13RikQ9D2T6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700034E13RikQ9D2T6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700034E13RikQ9D2T6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700034E13RikQ9D2T6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
1700034E13RikQ9D2T6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700034E13RikQ9D2T6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700034E13RikQ9D2T6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700034E13RikQ9D2T6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700034E13RikQ9D2T6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700034E13RikQ9D2T6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
1700034E13RikQ9D2T6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700034E13RikQ9D2T6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700034E13RikQ9D2T6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700034E13RikQ9D2T6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700034E13RikQ9D2T6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700034E13RikQ9D2T6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700034E13RikQ9D2T6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700034E13RikQ9D2T6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms