Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef12Q9D2F1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms