Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms