Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D1F3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D1F3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D1F3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D1F3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D1F3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D1F3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms